alors que wise et les autres progressent dans le sous-sol de nero 66 afin d’atteindre le all link system en vue de le détruire, voilà que se dressent devant eux les oceans 6. homura parvient à vaincre milani, wise doit affronter nasseh, maître de l’hypnose, et rebecca  est contrainte à un duel contre lyra.
de son côté, shiki cherche à rejoindre ses amis pour aller délivrer ensemble witch tombée entre les mains de shura. c’est alors qu’arrive justice... 
la grande bataille de nero 66 prend une nouvelle tournure bien plus complexe !