Nathan est un écolier tout à fait ordinaire. alors qu'il se promène dans les collines près de chez lui, il découvre whisper, un yo-kai très bavard. ce drôle de personnage lui offre une yo-kai watch, une montre qui lui permet de révéler la présence des yo-kai autour de lui. nathan va s'en servir pour convaincre les yo-kai de devenir ses amis et utiliser leurs pouvoirs pour faire le bien. le voilà embarqué dans une aventure extraordinaire !