Alors que les yoshis vivaient paisiblement sur l'île oeuf, un petit être tombe soudainement du ciel : bébé mario ! mais pourquoi est-il seul ? où est passé son frère bébé luigi ?!? hein ? il a été enlevé par bébé bowser ?!?yoshi décide alors de prendre bébé mario avec lui et de partir à sa recherche, pour le meilleur et pour le rire...